Berikut prinsip yang dapat membedakan kedua bioteknologi tersebut.
Bioteknologi konvesional tidak menggunakan prinsip ilmiah. Sedangkan Bioteknologi modern menggunakan prinsip ilmiah, misalnya rekayasa genetika.
Dan pada pembuatan yogurt ini tidak termasuk jenis bioteknologi modern karena pembuatan yogurt menggunakan prinsip fermentasi yang masuk ke dalam jenis bioteknologi konvesional sedangkan bioteknologi modern adalah teknik yang melibatkan rekayasa genetika sehingga menghasilkan DNA rekombinan dan organisme transgenik yang dapat dimanfaatkan untuk menghasilkan produk yang diinginkan seperti antibiotik, dan vaksin.