Keterbatasan SDM
Kapasitas Sumber Daya Manusia (SDM) aparatur pemerintah desa yang terbatas, sehingga pengelolaan keuangan desa bergantung pada beberapa orang saja.
Transparansi
Kurangnya pemahaman pentingnya transparansi pengelolaan keuangan desa bagi aparatur pemerintah desa.
Prosedur penyusunan SPj
Prosedur dan proses penyusunan pertanggungjawaban (SPj) dianggap rumit oleh aparatur pemerintah desa.
Ketergantungan pada Dana Desa
Tingginya ketergantungan desa pada Dana Desa membuat desa rentan terhadap fluktuasi pendanaan dan ketidakpastian anggaran.
Partisipasi masyarakat
Partisipasi masyarakat dalam pengelolaan dan pemanfaatan Dana Desa masih sangat minim.