Prinsip dasar bioteknologi konvensional adalah memanfaatkan mikroorganisme utuh secara langsung tanpa proses rekayasa sehingga pemanfaatannya masih sangat terbatas. Sedangkan prinsip dari bioteknologi modern merupakan pemanfaatan bagian dari mikroorganisme dengan melibatkan teknologi modern.
Proses pembuatan Yoghurt pada perusahaan besar termasuk Bioteknologi Modern karena telah menggunakan teknik yang modern dan menggunakan mesin-mesin canggih (teknologi) sehingga Kualitas dan kesterilannya terjamin walaupun dalam cara ilmiahnya proses pembuatan youghurt merupakan proses fermentasi dari bakteri.