Prinsip dasar yang membedakan bioteknologi konvensional dan bioteknologi modern adalah pada bioteknologi konvensional masih menggunakan organisme hidup yang masih alami serta belum melalui rekayasa organisme, serta jumlahnya terbatas. Sedangkan bioteknologi modern sudah melalui rekayasa organisme dan sudah menggunakan mesin canggih sehingga kualitasnya terjamin serta sudah melibatkan sel tertentu.
Dalam pembuatan yoghurt menggunakan mesin canggih dan produksi massal, belum masuk kedalam jenis bioteknologi modern. Karena belum melibatkan teknik rekayasa genetika dan belum melibatkan sel tertentu, serta pembuatan yoghurt masih masuk ke dalam jenis bioteknologi konvensional.