Prinsip dasar yang membedakan keduanya terletak pada tingkat intervensi dan teknik yang digunakan.
Mengenai pembuatan yogurt di era modern, meskipun menggunakan mesin canggih dan produksi massal, proses ini masih termasuk dalam bioteknologi konvensional. Alasannya:
1. Tidak melibatkan manipulasi genetik: Bakteri lactobacillus yang digunakan dalam pembuatan yogurt tetaplah lactobacillus alami, tidak dimodifikasi secara genetik.
2. Proses fermentasi: Proses pembuatan yogurt masih bergantung pada fermentasi laktosa oleh bakteri lactobacillus yang mengubah laktosa menjadi asam laktat.
3. Penggunaan mesin: Mesin dan produksi massal hanya meningkatkan efisiensi dan skala produksi, bukan mengubah prinsip dasarnya.